Ayer no me abría Cydia en todo el dia y al principio pensaba que estaba caido o algo similar, hasta que me fijé en el mensaje de error. La solución es bien sencilla. 1.- Acceder via SSH a tu iPhone. 2.- Ir a la ruta: /var/lib/apt/lists 3.- Borrar todo lo que hay en esa carpeta excepto la carpeta “partial” 4.- Abrir Cydia normalmente y esperar a que se actualice y listo!!

Fuente:
Solución a: Cydia Error Database Encountered no Package Header

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